22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4588 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 667 aa  1357    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  31.99 
 
 		 688 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  28.06 
 
 		 730 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  31.65 
 
 		 666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  25.86 
 
 		 739 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  23.77 
 
 		 816 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  33.74 
 
 		 1787 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  22.65 
 
 		 706 aa  87.4  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  22.18 
 
 		 706 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  22.83 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  19.13 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  22.42 
 
 		 708 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  20.42 
 
 		 563 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  21.11 
 
 		 704 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  27.17 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  22.15 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  33.8 
 
 		 589 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  22.48 
 
 		 550 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  22.48 
 
 		 550 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  26.01 
 
 		 495 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  19.39 
 
 		 677 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  20.77 
 
 		 441 aa  47.4  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>