33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6042 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
708 aa  1414    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  29.4 
 
 
706 aa  297  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  30.22 
 
 
706 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  27.6 
 
 
696 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  24.26 
 
 
677 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  22.79 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  24.25 
 
 
704 aa  77  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  23.28 
 
 
816 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  23.31 
 
 
730 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  25.1 
 
 
550 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  25.1 
 
 
550 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  26.13 
 
 
550 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  26.03 
 
 
1787 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  31.75 
 
 
454 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  40.58 
 
 
456 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.42 
 
 
667 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  22 
 
 
688 aa  54.3  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  21.45 
 
 
685 aa  52  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  25.29 
 
 
589 aa  51.6  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1219  hypothetical protein  21.6 
 
 
390 aa  51.2  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  35.62 
 
 
563 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  28.67 
 
 
261 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  30.46 
 
 
723 aa  49.3  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  34.21 
 
 
495 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  22.93 
 
 
549 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  28.92 
 
 
480 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  32.89 
 
 
367 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  28.92 
 
 
483 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  28.92 
 
 
480 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  32.88 
 
 
441 aa  47.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  32.73 
 
 
524 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2071  hypothetical protein  32.79 
 
 
437 aa  44.3  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  33.87 
 
 
520 aa  43.9  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>