18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0516 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  894    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0912  hypothetical protein  55.58 
 
 
443 aa  503  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.214315  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  52.18 
 
 
480 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  52.18 
 
 
483 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  51.53 
 
 
480 aa  487  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0112  hypothetical protein  43.88 
 
 
442 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1216  hypothetical protein  46.9 
 
 
387 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0162569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2071  hypothetical protein  39.26 
 
 
437 aa  324  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1219  hypothetical protein  41.77 
 
 
390 aa  301  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  25.3 
 
 
367 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  37.66 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  37.66 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  37.66 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  20.06 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
708 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.77 
 
 
667 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  22.4 
 
 
454 aa  47.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 
589 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>