29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3785 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  49.15 
 
 		 706 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  100 
 
 		 696 aa  1408    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  48.72 
 
 		 706 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  27.95 
 
 		 708 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  23.64 
 
 		 677 aa  102  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  22.43 
 
 		 730 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  22.56 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  19.76 
 
 		 704 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  24.33 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.83 
 
 		 667 aa  70.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  27.95 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  21.55 
 
 		 685 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  27.46 
 
 		 1787 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  23.16 
 
 		 666 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  25.25 
 
 		 367 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  28.18 
 
 		 261 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  32.1 
 
 		 589 aa  52.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  33.04 
 
 		 454 aa  51.2  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  20.06 
 
 		 657 aa  51.2  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  19.83 
 
 		 723 aa  50.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  20.39 
 
 		 688 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  21.75 
 
 		 550 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  21.75 
 
 		 550 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  21.56 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  21.88 
 
 		 563 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1216  hypothetical protein  25.29 
 
 		 387 aa  44.3  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0162569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  22.92 
 
 		 480 aa  44.3  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  22.92 
 
 		 483 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  22.92 
 
 		 480 aa  43.9  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>