20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0996 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  100 
 
 		 1787 aa  3492    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  32.68 
 
 		 730 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  34.36 
 
 		 739 aa  128  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  37.11 
 
 		 688 aa  125  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 667 aa  120  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  35 
 
 		 816 aa  99  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  40 
 
 		 666 aa  97.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  23.81 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  25.5 
 
 		 706 aa  70.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  23.51 
 
 		 708 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  27.46 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.71 
 
 		 1153 aa  55.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  35.92 
 
 		 495 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  28.63 
 
 		 356 aa  49.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  25.87 
 
 		 812 aa  48.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  27.42 
 
 		 677 aa  48.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  48.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  27.91 
 
 		 685 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  35.82 
 
 		 367 aa  47.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  27.33 
 
 		 454 aa  46.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>