55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2102 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  100 
 
 		 785 aa  1567    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  47.05 
 
 		 812 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  44.13 
 
 		 858 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  46.77 
 
 		 778 aa  588  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  44.86 
 
 		 872 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  40.45 
 
 		 938 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  40.45 
 
 		 938 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  40.45 
 
 		 938 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  43.39 
 
 		 723 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  43.52 
 
 		 696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  41.36 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  42.26 
 
 		 1045 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  42.59 
 
 		 938 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1018 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1018 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  43.1 
 
 		 935 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1015 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1015 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  42.38 
 
 		 1015 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1031 aa  362  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  42.64 
 
 		 935 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  42.64 
 
 		 935 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1095 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  44.34 
 
 		 698 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  48.32 
 
 		 698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  40.14 
 
 		 754 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  33.81 
 
 		 690 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  25 
 
 		 2331 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  24.33 
 
 		 2335 aa  61.6  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  22.02 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  38.03 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  26.51 
 
 		 677 aa  55.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.16 
 
 		 442 aa  54.7  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  23.27 
 
 		 708 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  31.25 
 
 		 495 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  31.37 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.88 
 
 		 362 aa  49.3  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  26.26 
 
 		 391 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  26.23 
 
 		 427 aa  48.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  20.05 
 
 		 706 aa  48.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  26.77 
 
 		 391 aa  47.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  47.8  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  27.88 
 
 		 462 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  27.88 
 
 		 462 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  27.88 
 
 		 462 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  27.88 
 
 		 462 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 		 462 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  30.3 
 
 		 549 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  28.77 
 
 		 399 aa  47  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  23.55 
 
 		 704 aa  45.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  20.99 
 
 		 706 aa  46.2  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  21.13 
 
 		 488 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  19.79 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  19.85 
 
 		 476 aa  44.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  31.87 
 
 		 391 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>