32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03062 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  67.18 
 
 		 938 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  64.28 
 
 		 696 aa  847    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  70.7 
 
 		 872 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  67.56 
 
 		 858 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  67.18 
 
 		 1018 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  67.98 
 
 		 938 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  64.18 
 
 		 778 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  68.77 
 
 		 938 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  74.07 
 
 		 698 aa  924    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  67.18 
 
 		 1018 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  67.18 
 
 		 938 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1365    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  58.32 
 
 		 1045 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  58.6 
 
 		 935 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  58.6 
 
 		 935 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  64.31 
 
 		 1095 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  63.51 
 
 		 1015 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  62.5 
 
 		 1015 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  62.55 
 
 		 935 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  64.11 
 
 		 1015 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  58.88 
 
 		 1031 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  67.4 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  46.55 
 
 		 754 aa  505  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  51.52 
 
 		 876 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  40.66 
 
 		 723 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  37.45 
 
 		 690 aa  340  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  48.32 
 
 		 785 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  23.39 
 
 		 563 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  28.91 
 
 		 330 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.98 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  26.27 
 
 		 358 aa  45.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  21.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>