35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3559 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  65.27 
 
 		 938 aa  1140    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  89.01 
 
 		 1095 aa  1262    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  77.54 
 
 		 1015 aa  1418    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 935 aa  1843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  52.61 
 
 		 812 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  58.06 
 
 		 1018 aa  1036    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  65.59 
 
 		 938 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  65.81 
 
 		 938 aa  1152    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  58.06 
 
 		 1018 aa  1036    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  65.27 
 
 		 938 aa  1140    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  91.76 
 
 		 935 aa  1633    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  81.87 
 
 		 1015 aa  1506    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  59.64 
 
 		 872 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  91.76 
 
 		 935 aa  1633    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  50.34 
 
 		 1031 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  65.33 
 
 		 778 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  81.08 
 
 		 1015 aa  1505    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  58.65 
 
 		 858 aa  957    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  46.44 
 
 		 1045 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  66.33 
 
 		 698 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  62.55 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  58.75 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  43.1 
 
 		 785 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  54.68 
 
 		 876 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  49.88 
 
 		 723 aa  361  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  41.38 
 
 		 754 aa  294  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  35.92 
 
 		 690 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  31.61 
 
 		 330 aa  53.9  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  36.62 
 
 		 563 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  23.12 
 
 		 2335 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.06 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  25.4 
 
 		 427 aa  47.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  28.85 
 
 		 708 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  30.14 
 
 		 549 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>