36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3867 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  49.86 
 
 
1031 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  55.27 
 
 
1018 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  62.64 
 
 
938 aa  865    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  63.32 
 
 
938 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  94.71 
 
 
935 aa  1342    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  78.38 
 
 
1015 aa  1566    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  62.91 
 
 
938 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  55.27 
 
 
1018 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  76.66 
 
 
1015 aa  1499    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  94.71 
 
 
935 aa  1342    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  100 
 
 
1095 aa  2147    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  67.01 
 
 
778 aa  722    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  89.01 
 
 
935 aa  1262    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  80.66 
 
 
1015 aa  1607    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  63.57 
 
 
858 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  50.45 
 
 
1045 aa  908    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  60.9 
 
 
872 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  62.64 
 
 
938 aa  865    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  68.15 
 
 
698 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  64.31 
 
 
698 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  59.36 
 
 
696 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  53.73 
 
 
812 aa  505  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  54.43 
 
 
876 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.04 
 
 
785 aa  364  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  50 
 
 
723 aa  357  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  41.08 
 
 
754 aa  288  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  35.15 
 
 
690 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  36.62 
 
 
563 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  30.72 
 
 
330 aa  53.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  25.56 
 
 
427 aa  51.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 
495 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.06 
 
 
442 aa  50.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  28.85 
 
 
708 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  27.62 
 
 
549 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  45.78 
 
 
677 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25.16 
 
 
2327 aa  44.7  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>