42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4484 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  62.3 
 
 		 938 aa  1031    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  66.16 
 
 		 696 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  100 
 
 		 872 aa  1719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  59.64 
 
 		 935 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  60.75 
 
 		 1095 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  60.24 
 
 		 1015 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  64.89 
 
 		 1018 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  62.09 
 
 		 938 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  62.3 
 
 		 938 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  64.89 
 
 		 1018 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  62.3 
 
 		 938 aa  1031    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  58.7 
 
 		 935 aa  951    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  59.5 
 
 		 1015 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  58.7 
 
 		 935 aa  951    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  64.33 
 
 		 1045 aa  864    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  68.98 
 
 		 858 aa  1109    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  59.79 
 
 		 1015 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  58.61 
 
 		 1031 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  90.36 
 
 		 698 aa  875    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  68.82 
 
 		 778 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  70.57 
 
 		 698 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  58.04 
 
 		 812 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  44.23 
 
 		 785 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  42.81 
 
 		 723 aa  429  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  59.1 
 
 		 876 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  44.48 
 
 		 754 aa  340  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  33.51 
 
 		 690 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  36.62 
 
 		 563 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.1 
 
 		 696 aa  52  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.06 
 
 		 442 aa  50.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  34.07 
 
 		 677 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  32.1 
 
 		 330 aa  48.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  27.51 
 
 		 2327 aa  47.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  30.14 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  23.14 
 
 		 706 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  23.25 
 
 		 706 aa  45.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1874 aa  44.3  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  26.79 
 
 		 462 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  26.79 
 
 		 462 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  26.79 
 
 		 462 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.79 
 
 		 462 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>