22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4508 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  98.27 
 
 		 462 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  98.05 
 
 		 462 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  100 
 
 		 462 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  98.05 
 
 		 462 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  97.62 
 
 		 462 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  22.17 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  35.71 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  24.18 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.68 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  41.54 
 
 		 328 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  25.14 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  25.25 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  31.71 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  26.96 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.83 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  37.14 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  36.49 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  33.68 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  36.49 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  36.92 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  20.62 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>