53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2830 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  49.74 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.12 
 
 
442 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.94 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  39.3 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  41.95 
 
 
330 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  43.93 
 
 
359 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49.57 
 
 
242 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  45.77 
 
 
320 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  35.45 
 
 
392 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  40.06 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  44.8 
 
 
353 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  39.75 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  38.01 
 
 
368 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  38.29 
 
 
358 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  46.52 
 
 
330 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  40.32 
 
 
399 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  31.69 
 
 
391 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  34.1 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  37.1 
 
 
324 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  32.63 
 
 
391 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  38.27 
 
 
332 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  33.82 
 
 
391 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  46.8 
 
 
335 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  42.35 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  37.54 
 
 
328 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  37.81 
 
 
367 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  37.19 
 
 
368 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  36.91 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  49.55 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  35.87 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  35.87 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  45.45 
 
 
349 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  39.53 
 
 
337 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  40.62 
 
 
330 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  44.71 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  50.49 
 
 
359 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  32.89 
 
 
569 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  39.46 
 
 
328 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  44.29 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  44.29 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  44.29 
 
 
462 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  44.29 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.29 
 
 
462 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  27.43 
 
 
723 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.64 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  20 
 
 
476 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  24.75 
 
 
549 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  24.83 
 
 
563 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  20 
 
 
476 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  40.3 
 
 
445 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  26.85 
 
 
524 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  24.62 
 
 
488 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>