54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2638 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  96.96 
 
 
330 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  75.15 
 
 
328 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  69.07 
 
 
328 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  67.16 
 
 
328 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  49.25 
 
 
353 aa  285  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  52.96 
 
 
330 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  50.76 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  48.95 
 
 
358 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  49.23 
 
 
339 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  50.76 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  49.85 
 
 
332 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  50.47 
 
 
324 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  51.71 
 
 
335 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  47.81 
 
 
368 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  48.75 
 
 
337 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  47.13 
 
 
367 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  46.53 
 
 
368 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  47.71 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  43.03 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  44.8 
 
 
359 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  46.58 
 
 
349 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.37 
 
 
442 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  45.03 
 
 
320 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.88 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  38.72 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  38.41 
 
 
377 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  35.9 
 
 
330 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  40.89 
 
 
359 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  35.87 
 
 
328 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  40 
 
 
427 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44 
 
 
242 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  39.93 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  34.43 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  38.83 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  39.07 
 
 
569 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  31.95 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  31.32 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  39.47 
 
 
723 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  29.22 
 
 
445 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  20.18 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  31.48 
 
 
495 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  27.95 
 
 
524 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  24.49 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  26.29 
 
 
476 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  31.91 
 
 
563 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  26.79 
 
 
549 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  38.16 
 
 
1045 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.61 
 
 
478 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.32 
 
 
462 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  23.32 
 
 
462 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  23.32 
 
 
462 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  23.32 
 
 
462 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>