47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1405 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1092    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  62.14 
 
 		 392 aa  334  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  55.26 
 
 		 427 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  53.53 
 
 		 391 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  50.82 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  50.54 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  48.99 
 
 		 399 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.89 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  37.8 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  41.55 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  36.59 
 
 		 377 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  42.8 
 
 		 358 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  39.62 
 
 		 330 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  42.8 
 
 		 339 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  41.13 
 
 		 333 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.67 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  41.95 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  43.98 
 
 		 335 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  41.13 
 
 		 359 aa  144  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  42.91 
 
 		 353 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  42.34 
 
 		 337 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  37.99 
 
 		 337 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  40.28 
 
 		 349 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  43.03 
 
 		 320 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  47.13 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  38.78 
 
 		 328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  39.56 
 
 		 381 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  38.32 
 
 		 368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  39.59 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  38.41 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  32.53 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  39.42 
 
 		 328 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.74 
 
 		 242 aa  120  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  42.56 
 
 		 359 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  38.04 
 
 		 328 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  35.71 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  37.82 
 
 		 330 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  25.76 
 
 		 476 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  25.76 
 
 		 476 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  32.91 
 
 		 563 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  26.98 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  31.58 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 723 aa  45.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5348  hypothetical protein  27.11 
 
 		 259 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.0360105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  22.4 
 
 		 462 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>