49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2209 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  89.23 
 
 
391 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  88.72 
 
 
391 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  56.88 
 
 
392 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  54.87 
 
 
427 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  51.2 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  51.9 
 
 
569 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  36.46 
 
 
377 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.7 
 
 
442 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  42.32 
 
 
330 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.58 
 
 
362 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  42.16 
 
 
339 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  41.18 
 
 
333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  38.4 
 
 
353 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  41.97 
 
 
332 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  41.69 
 
 
359 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  45.42 
 
 
330 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  37.25 
 
 
381 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  45.23 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  42.09 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  33.07 
 
 
328 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  45.99 
 
 
320 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  38.17 
 
 
368 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  38.84 
 
 
337 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  38.58 
 
 
349 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  39.12 
 
 
349 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  50.76 
 
 
359 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  34.97 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  42.36 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.84 
 
 
242 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  35.55 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  38.41 
 
 
337 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  33.73 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  37.99 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  38.21 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  32.84 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  31.5 
 
 
330 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  31.51 
 
 
331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  30.93 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  29.19 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  23.28 
 
 
563 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  29.31 
 
 
476 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  28.45 
 
 
476 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  26.7 
 
 
495 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  28.57 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  19.08 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  33.72 
 
 
549 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  29.52 
 
 
723 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  22.99 
 
 
524 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>