35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1849 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1059    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  43.76 
 
 
563 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  42.83 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  36.94 
 
 
549 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  26 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  25.07 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  25.73 
 
 
476 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  25.94 
 
 
399 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  26.43 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.86 
 
 
442 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  24.22 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  26.04 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  28.38 
 
 
706 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  28.57 
 
 
706 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  44.93 
 
 
456 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  24.53 
 
 
367 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  27.97 
 
 
427 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  32.73 
 
 
708 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  31.07 
 
 
569 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  24.7 
 
 
391 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  27.97 
 
 
677 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  25.56 
 
 
391 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  27.03 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  27.62 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  27.07 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
362 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 
667 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  24.74 
 
 
723 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
462 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  37.14 
 
 
462 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
462 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
462 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.14 
 
 
462 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  27.34 
 
 
520 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  34.94 
 
 
324 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>