32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4289 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  100 
 
 
549 aa  1100    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  39.32 
 
 
563 aa  354  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  37.22 
 
 
524 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  37.42 
 
 
495 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  20.37 
 
 
488 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  31.25 
 
 
476 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  31.25 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  23.76 
 
 
454 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  35.71 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  23.25 
 
 
381 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  22.7 
 
 
706 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.67 
 
 
362 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  28.16 
 
 
377 aa  48.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  22.93 
 
 
708 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  35.62 
 
 
677 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  19.07 
 
 
723 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  28.85 
 
 
706 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  28.74 
 
 
358 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  32.93 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  33.72 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  33.72 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  23.89 
 
 
985 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  33.72 
 
 
391 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  28.75 
 
 
367 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  29.05 
 
 
368 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.9 
 
 
667 aa  43.5  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>