55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2664 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  68.29 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  72.16 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  64.56 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  66.18 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  64.05 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  63.85 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  48.41 
 
 		 353 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  50.15 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  51.58 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  49.39 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  49.85 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  49.41 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  51.26 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  47.71 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  48.12 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  48.61 
 
 		 328 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  49.4 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  48.91 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  46.25 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  46.25 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  46.06 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  47.95 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  50.14 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.79 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  40.66 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  41.28 
 
 		 377 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.42 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  48.19 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49.78 
 
 		 242 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  43.2 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  38.39 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  43.72 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  45.74 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  39.79 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  37.5 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  36.95 
 
 		 569 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  36.75 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  37.68 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  24.65 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  26.29 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  30 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  35.92 
 
 		 495 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  25.21 
 
 		 524 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  29.81 
 
 		 549 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  22.71 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  20.09 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  39.44 
 
 		 462 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 		 462 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  39.44 
 
 		 462 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  39.44 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  25.27 
 
 		 563 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1161  hypothetical protein  27.9 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>