49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2317 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  96.96 
 
 		 331 aa  577  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  96.96 
 
 		 334 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  75.45 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  69.79 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  67.56 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  52.65 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  50.45 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  48.65 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  49.54 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  48.65 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  51.7 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  50.15 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  50.15 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  51.09 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  47.63 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  48.75 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  46.93 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  46.93 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  47.24 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  46.58 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  43.12 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  44.9 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.59 
 
 		 442 aa  195  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  43.65 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  39.02 
 
 		 377 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.88 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  39.39 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  41.6 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  35.9 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  41.24 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  41.41 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  40.14 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44 
 
 		 242 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  34.66 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  38.83 
 
 		 391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  35.83 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  39.07 
 
 		 569 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  31.69 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  39.47 
 
 		 723 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  29.68 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.14 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  26.11 
 
 		 495 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  25.13 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  27.95 
 
 		 524 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  22.8 
 
 		 476 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  28.89 
 
 		 549 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1045 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  30.85 
 
 		 563 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>