54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3671 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  69.33 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  64.86 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  69.54 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  61.13 
 
 		 337 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  62.5 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  61.89 
 
 		 349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  47.58 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  50.32 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  50.31 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  48.34 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  46.04 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  49.85 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  48.17 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  49.1 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  44.97 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  44.58 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  48.58 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  49.35 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.56 
 
 		 442 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  43.03 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  41.95 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  41.95 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  42.02 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  46.96 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  40 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  36.14 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  38.53 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  47 
 
 		 391 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  40.45 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.07 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  49.17 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.16 
 
 		 242 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  39.53 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  37.87 
 
 		 399 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  37.46 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  37.93 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  38.18 
 
 		 569 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  50.88 
 
 		 381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  28.29 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  24.5 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  24.49 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  33 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.47 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  24.24 
 
 		 563 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  27.62 
 
 		 495 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  29.69 
 
 		 462 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.16 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  26.16 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  26.16 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  26.16 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  24.87 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  30.08 
 
 		 549 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>