53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2099 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  52.37 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  54.03 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.85 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  51.76 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  50.31 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  49.52 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  52.19 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  49.53 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  48.25 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  42.94 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  49.01 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  51.68 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  50 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  46.46 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  49.35 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  46.13 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  45.2 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  51.99 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  51.23 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  51.74 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  45.51 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  46.08 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  41.89 
 
 		 427 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.81 
 
 		 242 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  46.42 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  44.04 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  43.17 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  49.53 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  45.34 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  45.34 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  40 
 
 		 392 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  44.94 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  38.44 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  39.25 
 
 		 391 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  39.45 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  43.58 
 
 		 569 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  23.47 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  41.67 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  24.49 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  30.3 
 
 		 723 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  27.27 
 
 		 495 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  34.69 
 
 		 563 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  25.26 
 
 		 549 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.24 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  29.6 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  38.57 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  38.57 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  38.57 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  38.57 
 
 		 462 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  38.57 
 
 		 462 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>