39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1787 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  48.45 
 
 
1031 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  97.53 
 
 
938 aa  1740    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  68.77 
 
 
698 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  84.85 
 
 
1018 aa  1564    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
938 aa  1831    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  65.67 
 
 
935 aa  1131    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  59.25 
 
 
1015 aa  1053    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  97.85 
 
 
938 aa  1751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  84.85 
 
 
1018 aa  1564    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  58.7 
 
 
1015 aa  1018    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  65.67 
 
 
935 aa  1131    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  69.57 
 
 
698 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  63.32 
 
 
1095 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  85.67 
 
 
778 aa  962    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  65.85 
 
 
935 aa  1132    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  59.35 
 
 
1015 aa  1049    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  81.2 
 
 
858 aa  1367    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  59.5 
 
 
872 aa  939    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  49.29 
 
 
876 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  97.53 
 
 
938 aa  1740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  61 
 
 
696 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  53.93 
 
 
812 aa  532  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  53.07 
 
 
1045 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.66 
 
 
785 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  45.1 
 
 
723 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  43.88 
 
 
754 aa  326  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  35.12 
 
 
690 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  33.8 
 
 
563 aa  51.6  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.36 
 
 
442 aa  50.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  35.8 
 
 
330 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  21.62 
 
 
549 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32 
 
 
495 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.25 
 
 
1896 aa  48.5  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.84 
 
 
696 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  29.76 
 
 
708 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  32.59 
 
 
367 aa  45.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  26.7 
 
 
2955 aa  45.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  26.4 
 
 
427 aa  45.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  38.2 
 
 
677 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>