50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1177 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  100 
 
 
243 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0299  coiled-coil protein  45.39 
 
 
146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  36.27 
 
 
357 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  21.8 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  32.82 
 
 
178 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
1239 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  19.21 
 
 
2228 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.98 
 
 
1235 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  22.69 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  29.81 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  25 
 
 
526 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  28.44 
 
 
173 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  29.21 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  26.88 
 
 
177 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4585  hypothetical protein  39.19 
 
 
143 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0352075  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  29.46 
 
 
385 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  24.63 
 
 
932 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  26.9 
 
 
985 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  21.3 
 
 
361 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  19.39 
 
 
1185 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  22.13 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3898  chromosome segregation ATPases-like protein  26.79 
 
 
777 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2700  hypothetical protein  20.39 
 
 
145 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  23.32 
 
 
567 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  22.28 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 
782 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  18.45 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00317  EF hand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02540)  20 
 
 
1258 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329478  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.37 
 
 
1170 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  20.25 
 
 
924 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 
825 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0067  hypothetical protein  37.88 
 
 
100 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0521488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  27.85 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  20.25 
 
 
923 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  24.36 
 
 
852 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  23.12 
 
 
403 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  23.12 
 
 
403 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  22.27 
 
 
1111 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  22.92 
 
 
993 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0786  cell wall anchor domain-containing protein  19.11 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  28.08 
 
 
356 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
996 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  20.81 
 
 
869 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1101  hypothetical protein  23.85 
 
 
157 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  26.44 
 
 
640 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  23.24 
 
 
869 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  23.24 
 
 
869 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1850  hypothetical protein  24.83 
 
 
451 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.24 
 
 
869 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  26.79 
 
 
919 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>