53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3381 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  52.5 
 
 
198 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0574  hypothetical protein  35.98 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  29.65 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  27.54 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  33.7 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.44 
 
 
782 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  20.99 
 
 
772 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  29.68 
 
 
317 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  24.22 
 
 
1246 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  26.72 
 
 
1132 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 
1132 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  26.71 
 
 
385 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2155  hypothetical protein  36.04 
 
 
108 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.332318  normal  0.0169031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  25.53 
 
 
819 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  27.81 
 
 
1037 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  23.84 
 
 
924 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  20.71 
 
 
1362 aa  49.3  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  23.84 
 
 
923 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1084  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00445822  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 
733 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  27.32 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  27.32 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.36 
 
 
1621 aa  48.5  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  25.87 
 
 
919 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  25.34 
 
 
1111 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  22.93 
 
 
869 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  22.93 
 
 
869 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  22.93 
 
 
869 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  23.33 
 
 
863 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  22.93 
 
 
869 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 
825 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  23.95 
 
 
988 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  22.63 
 
 
915 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0224  hypothetical protein  72.41 
 
 
132 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  20.41 
 
 
2228 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  21.02 
 
 
1092 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.72 
 
 
797 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  21.99 
 
 
911 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.81 
 
 
769 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25 
 
 
711 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  22.61 
 
 
7659 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  27.85 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.18 
 
 
737 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  23.33 
 
 
1002 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  28 
 
 
678 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2351  hypothetical protein  75 
 
 
166 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00600  endocytosis-related protein, putative  21.09 
 
 
1601 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  26.17 
 
 
1040 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.51 
 
 
666 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  22.7 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1367  hypothetical protein  32.95 
 
 
220 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>