28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1084 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1084  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  380  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00445822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  24.48 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  37.08 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  37.08 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  22.56 
 
 
1621 aa  61.6  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3732  hypothetical protein  36.17 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0173344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  20.99 
 
 
1362 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  24.29 
 
 
2228 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  32.26 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0809  hypothetical protein  30.61 
 
 
123 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  26.88 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5241  hypothetical protein  35.9 
 
 
107 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4211  hypothetical protein  26.79 
 
 
126 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4444  hypothetical protein  34.67 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
988 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1717  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000408974  normal  0.774956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0076  hypothetical protein  28.92 
 
 
133 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1806  hypothetical protein  21.43 
 
 
595 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  26.5 
 
 
357 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1389  hypothetical protein  26.82 
 
 
898 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  27.1 
 
 
438 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  27.1 
 
 
438 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4501  hypothetical protein  22.33 
 
 
137 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  22.11 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  25.93 
 
 
932 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  20.91 
 
 
353 aa  41.6  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0982  hypothetical protein  24.04 
 
 
183 aa  41.2  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.226154  normal  0.782493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>