54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3269 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  100 
 
 
198 aa  380  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  52.5 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0574  hypothetical protein  36.46 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  28.72 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4507  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0809349  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  24.1 
 
 
336 aa  59.3  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  26.17 
 
 
317 aa  58.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  27.12 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  27.03 
 
 
353 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.68 
 
 
769 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1084  hypothetical protein  32.26 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00445822  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  30.6 
 
 
1037 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  32.43 
 
 
1246 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24 
 
 
869 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  28.93 
 
 
252 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  28.93 
 
 
252 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  26.56 
 
 
357 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.26 
 
 
711 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  18.44 
 
 
1362 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  23.33 
 
 
869 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4501  hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  23.33 
 
 
869 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  23.33 
 
 
869 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  23.36 
 
 
915 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.91 
 
 
1132 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1167  hypothetical protein  40 
 
 
439 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.018342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  18 
 
 
2228 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  25.41 
 
 
888 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2351  hypothetical protein  56.76 
 
 
166 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.45 
 
 
782 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  23.58 
 
 
819 aa  44.7  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0224  hypothetical protein  75 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25 
 
 
772 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.31 
 
 
732 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  20.78 
 
 
924 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  25.6 
 
 
623 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.19 
 
 
1132 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  29.37 
 
 
1054 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  25.81 
 
 
919 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  28.46 
 
 
1040 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0809  hypothetical protein  28.47 
 
 
123 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  24.37 
 
 
1038 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  24.83 
 
 
1359 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  25.81 
 
 
932 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  29.33 
 
 
1654 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  27.66 
 
 
179 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  18.5 
 
 
923 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.25 
 
 
683 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  27.05 
 
 
1038 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  27.05 
 
 
1041 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  27.05 
 
 
1041 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00317  EF hand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02540)  28.28 
 
 
1258 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329478  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  27.88 
 
 
1002 aa  41.2  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9250  hypothetical protein  29.58 
 
 
556 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357084  normal  0.998614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>