156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0746 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 1132 aa  2266    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  96.55 
 
 		 1132 aa  2190    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 		 1177 aa  560  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 1016 aa  527  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  29.99 
 
 		 1090 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 1110 aa  488  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.44 
 
 		 1232 aa  480  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 1143 aa  475  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  39 
 
 		 947 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  39.03 
 
 		 868 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  37.34 
 
 		 859 aa  428  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.71 
 
 		 1211 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  28.56 
 
 		 1068 aa  360  6e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  34.88 
 
 		 876 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 917 aa  266  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 774 aa  257  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 		 792 aa  255  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.71 
 
 		 791 aa  180  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 792 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 759 aa  167  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 		 797 aa  159  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  24.95 
 
 		 787 aa  155  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  25.65 
 
 		 787 aa  155  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 789 aa  154  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 789 aa  154  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 787 aa  152  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 773 aa  151  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  24.64 
 
 		 789 aa  149  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  25.66 
 
 		 788 aa  148  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 		 787 aa  148  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  24.41 
 
 		 788 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  24.82 
 
 		 787 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 790 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 792 aa  141  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 787 aa  141  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.63 
 
 		 788 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  22.84 
 
 		 787 aa  136  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  23.81 
 
 		 787 aa  135  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  22.04 
 
 		 789 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  23.12 
 
 		 793 aa  128  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 786 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  24.12 
 
 		 787 aa  126  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  24.31 
 
 		 793 aa  125  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  24.11 
 
 		 791 aa  125  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  22.2 
 
 		 787 aa  123  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  22.32 
 
 		 786 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  21.73 
 
 		 787 aa  121  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  22.68 
 
 		 789 aa  118  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  23.24 
 
 		 787 aa  116  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  22.44 
 
 		 788 aa  116  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 787 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  21.31 
 
 		 788 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  24.42 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  21.85 
 
 		 790 aa  111  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 786 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  22.75 
 
 		 793 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  22.18 
 
 		 737 aa  107  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  22.01 
 
 		 800 aa  105  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  21.29 
 
 		 789 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  22.12 
 
 		 787 aa  94  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.72 
 
 		 749 aa  92.8  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 		 743 aa  87.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  19.44 
 
 		 782 aa  67.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 		 859 aa  67.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  22.26 
 
 		 882 aa  64.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  19.47 
 
 		 811 aa  64.3  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.7 
 
 		 737 aa  62.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  26.2 
 
 		 666 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.84 
 
 		 769 aa  57.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  21.75 
 
 		 915 aa  57.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  22.8 
 
 		 623 aa  55.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1807  hypothetical protein  43.48 
 
 		 330 aa  55.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.77 
 
 		 797 aa  55.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  20.97 
 
 		 683 aa  55.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  24.13 
 
 		 1111 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  21.05 
 
 		 733 aa  54.3  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  29.91 
 
 		 786 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  23.22 
 
 		 422 aa  54.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 		 385 aa  54.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  22.12 
 
 		 1040 aa  54.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.95 
 
 		 422 aa  53.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.29 
 
 		 419 aa  53.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.36 
 
 		 946 aa  53.5  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  24.49 
 
 		 666 aa  53.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.38 
 
 		 411 aa  53.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 		 838 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  22.47 
 
 		 649 aa  53.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.44 
 
 		 666 aa  52.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  29.66 
 
 		 414 aa  52.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  23.75 
 
 		 958 aa  52.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.66 
 
 		 414 aa  52.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  52  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  24.58 
 
 		 1429 aa  51.6  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  25.99 
 
 		 453 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.46 
 
 		 382 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  24.8 
 
 		 401 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  21.86 
 
 		 759 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 884 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1092 aa  50.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  25 
 
 		 856 aa  50.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>