35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2351 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  303  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  31.06 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4157  hypothetical protein  53.66 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0018779  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  40.71 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28 
 
 		 692 aa  53.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  46.99 
 
 		 380 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  39.42 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0224  hypothetical protein  76.67 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1092 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0270  hypothetical protein  37.68 
 
 		 110 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  45.59 
 
 		 627 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  40 
 
 		 324 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 1816 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  38.53 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  47.27 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0557  hypothetical protein  38.14 
 
 		 272 aa  44.7  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  25.58 
 
 		 958 aa  44.3  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0387  hypothetical protein  36.56 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0846  hypothetical protein  35.14 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 1695 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  27.85 
 
 		 1132 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  31.54 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 2099 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  38.71 
 
 		 631 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  28.7 
 
 		 143 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 1857 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1166  hypothetical protein  28.12 
 
 		 136 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1839 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 1132 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 2099 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.38 
 
 		 1211 aa  41.2  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>