159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0729 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  96.55 
 
 		 1132 aa  2190    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 1132 aa  2266    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 		 1177 aa  560  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 		 1016 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  30.01 
 
 		 1090 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 		 1110 aa  494  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.19 
 
 		 1232 aa  472  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 1143 aa  464  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  39.59 
 
 		 947 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  38.88 
 
 		 868 aa  452  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  37.5 
 
 		 859 aa  429  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.57 
 
 		 1211 aa  416  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 		 1068 aa  366  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  33.58 
 
 		 876 aa  360  7e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 917 aa  263  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 774 aa  255  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 		 792 aa  253  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.54 
 
 		 791 aa  179  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 792 aa  178  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 759 aa  164  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 797 aa  157  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  25.55 
 
 		 787 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 787 aa  155  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  25.57 
 
 		 787 aa  154  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 789 aa  154  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 789 aa  154  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 787 aa  152  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  25 
 
 		 788 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 773 aa  146  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  24.96 
 
 		 787 aa  145  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  24.6 
 
 		 789 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 788 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 787 aa  141  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  23.83 
 
 		 787 aa  140  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  23.82 
 
 		 788 aa  138  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 		 790 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  22.22 
 
 		 789 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  23.23 
 
 		 787 aa  126  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 		 786 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  24.13 
 
 		 793 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  23.94 
 
 		 791 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  23.66 
 
 		 787 aa  122  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  23.05 
 
 		 789 aa  119  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  21.59 
 
 		 787 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  21.85 
 
 		 788 aa  117  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  22.32 
 
 		 793 aa  117  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  21.2 
 
 		 787 aa  115  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  24.63 
 
 		 787 aa  112  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 787 aa  112  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  22.36 
 
 		 788 aa  111  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  23 
 
 		 787 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  23.72 
 
 		 793 aa  108  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  22.12 
 
 		 789 aa  108  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 786 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 		 737 aa  106  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  22.34 
 
 		 790 aa  105  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  23.49 
 
 		 786 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  22.12 
 
 		 800 aa  102  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  21.34 
 
 		 787 aa  91.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 743 aa  89.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  19.56 
 
 		 749 aa  87  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  19.91 
 
 		 811 aa  67.4  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  20.96 
 
 		 859 aa  67  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.61 
 
 		 737 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  22.03 
 
 		 915 aa  60.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.74 
 
 		 666 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  24.46 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.16 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.35 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.1 
 
 		 782 aa  57.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  23.31 
 
 		 666 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  21.52 
 
 		 797 aa  56.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.74 
 
 		 769 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  21.34 
 
 		 882 aa  55.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  22.72 
 
 		 772 aa  55.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  23.08 
 
 		 666 aa  55.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  23.08 
 
 		 666 aa  55.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  22.53 
 
 		 623 aa  55.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  18.82 
 
 		 683 aa  54.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  29.41 
 
 		 1429 aa  54.3  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  29.91 
 
 		 786 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  19.64 
 
 		 805 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  19.24 
 
 		 819 aa  53.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  53.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1807  hypothetical protein  42.03 
 
 		 330 aa  53.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 385 aa  53.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1092 aa  52.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 838 aa  52.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  23.71 
 
 		 666 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  19.71 
 
 		 631 aa  52.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.2 
 
 		 422 aa  52.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  25.2 
 
 		 401 aa  52  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  26.42 
 
 		 453 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  22.85 
 
 		 422 aa  52  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 856 aa  52  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  23.16 
 
 		 512 aa  52  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.73 
 
 		 382 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  20.77 
 
 		 1037 aa  51.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  31.34 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>