72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3196 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  54.13 
 
 
212 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  51.97 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  56.12 
 
 
143 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3009  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  40.31 
 
 
132 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000773583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  50.81 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  39.44 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 
748 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 
748 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 
748 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0359  hypothetical protein  38.61 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0572296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
762 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 
748 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1241  hypothetical protein  34.91 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0655211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  30.91 
 
 
763 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  30 
 
 
763 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1386  hypothetical protein  38.38 
 
 
487 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  30 
 
 
763 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  31.03 
 
 
745 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  25.51 
 
 
567 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
1991 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0969  KID repeat-containing protein  25.93 
 
 
1702 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0549  hypothetical protein  22.82 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  27.47 
 
 
349 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  19.15 
 
 
2228 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1101  hypothetical protein  43.06 
 
 
157 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  27.22 
 
 
408 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  26.58 
 
 
177 aa  55.5  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  21.91 
 
 
694 aa  55.1  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0557  hypothetical protein  35.29 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  15.34 
 
 
786 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  29.09 
 
 
356 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  26.9 
 
 
708 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1076  hypothetical protein  31.13 
 
 
166 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.67569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  35.37 
 
 
179 aa  52  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  21.05 
 
 
229 aa  52  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3590  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  25.76 
 
 
740 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.22 
 
 
1235 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2700  hypothetical protein  21.98 
 
 
145 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  25.9 
 
 
1209 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  19.85 
 
 
278 aa  48.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1166  hypothetical protein  26.6 
 
 
136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1806  hypothetical protein  27.68 
 
 
595 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13876  predicted protein  28.85 
 
 
542 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2219  hypothetical protein  25.19 
 
 
717 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  20.59 
 
 
737 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  23.12 
 
 
978 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1232  hypothetical protein  41.43 
 
 
99 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1367  hypothetical protein  27.63 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  23.12 
 
 
913 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  14.52 
 
 
1621 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0394  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.99 
 
 
787 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  22.28 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02600  hypothetical protein  21.8 
 
 
908 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  24.84 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8257  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  28 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4769  hypothetical protein  39.29 
 
 
110 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  23.46 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3236  hypothetical protein  30.3 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  30.15 
 
 
1587 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0791  hypothetical protein  35.8 
 
 
96 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  30.28 
 
 
507 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3579  phage minor structural protein  21.05 
 
 
1564 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.790906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  21.67 
 
 
2115 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>