26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1076 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1076  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.67569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1386  hypothetical protein  94.74 
 
 
487 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1241  hypothetical protein  92.13 
 
 
178 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0655211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0359  hypothetical protein  85.05 
 
 
194 aa  283  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0572296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0791  hypothetical protein  89.89 
 
 
96 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1232  hypothetical protein  85.56 
 
 
99 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  63.64 
 
 
731 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3379  hypothetical protein  45.78 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0287  hypothetical protein  45.57 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  31.13 
 
 
209 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2069  phosphotransferase enzyme family protein  62.26 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  34.48 
 
 
1246 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3345  hypothetical protein  46.74 
 
 
108 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  31.82 
 
 
759 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  45.07 
 
 
1012 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  45.07 
 
 
962 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  45.07 
 
 
1186 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  45.07 
 
 
1068 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03460  hypothetical protein  43.14 
 
 
64 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  33.08 
 
 
740 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  29.55 
 
 
924 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  33.73 
 
 
1111 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  29.55 
 
 
923 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  32.35 
 
 
882 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  37.5 
 
 
827 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  35.62 
 
 
1065 aa  40.8  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>