39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1386 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1386  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  889    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1241  hypothetical protein  94.38 
 
 
178 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0655211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0359  hypothetical protein  87.11 
 
 
194 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0572296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1076  hypothetical protein  94.74 
 
 
166 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.67569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0791  hypothetical protein  84.04 
 
 
96 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1232  hypothetical protein  85.26 
 
 
99 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  67.42 
 
 
731 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  38.38 
 
 
209 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3379  hypothetical protein  44.58 
 
 
152 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0287  hypothetical protein  44.71 
 
 
138 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  32.58 
 
 
1111 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1188  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  54.65 
 
 
1354 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  33.06 
 
 
1246 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
759 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  33.76 
 
 
740 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2069  phosphotransferase enzyme family protein  54.05 
 
 
142 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  31.76 
 
 
923 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  31.76 
 
 
924 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 
762 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  31.03 
 
 
1114 aa  47  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  28.89 
 
 
869 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  28.89 
 
 
869 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  28.89 
 
 
869 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3385  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  43.94 
 
 
165 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  28.24 
 
 
869 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.26 
 
 
782 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  44.05 
 
 
1012 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  37.5 
 
 
1654 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  37.33 
 
 
1065 aa  44.3  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3345  hypothetical protein  48.39 
 
 
108 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  28.57 
 
 
911 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  44.05 
 
 
1068 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  40.4 
 
 
1186 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>