45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1241 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1241  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  321  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0655211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0359  hypothetical protein  89.69 
 
 
194 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0572296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1386  hypothetical protein  94.38 
 
 
487 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1076  hypothetical protein  92.13 
 
 
166 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.67569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0791  hypothetical protein  78.22 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1232  hypothetical protein  78.43 
 
 
99 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  66.32 
 
 
731 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3379  hypothetical protein  48.35 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0287  hypothetical protein  49.41 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  34.91 
 
 
209 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  32.98 
 
 
1111 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  33.02 
 
 
1246 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3345  hypothetical protein  54.84 
 
 
108 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  31.91 
 
 
924 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  31.91 
 
 
923 aa  50.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  33.82 
 
 
740 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0789  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2069  phosphotransferase enzyme family protein  62.26 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  32.32 
 
 
759 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  36.89 
 
 
1068 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  40.22 
 
 
1186 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  40.22 
 
 
1012 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  27.78 
 
 
1114 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  39.13 
 
 
962 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1188  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  54.43 
 
 
1354 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  34.31 
 
 
732 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.57 
 
 
782 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  27.78 
 
 
869 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  37.89 
 
 
617 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  29.63 
 
 
882 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  27.78 
 
 
869 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  27.78 
 
 
869 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.6 
 
 
911 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  39.08 
 
 
827 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  28.26 
 
 
869 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2373  hypothetical protein  50.94 
 
 
142 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3385  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  42.25 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  21.21 
 
 
711 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  37.5 
 
 
1654 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03460  hypothetical protein  43.14 
 
 
64 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  38.1 
 
 
1065 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3525  hypothetical protein  35.42 
 
 
105 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1176  hypothetical protein  36.21 
 
 
127 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.95 
 
 
946 aa  41.2  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  34.34 
 
 
737 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>