More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0445 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  97.51 
 
 
763 aa  1375    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  89.52 
 
 
762 aa  1309    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
748 aa  1516    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
748 aa  1516    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  89.52 
 
 
762 aa  1309    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  59.19 
 
 
644 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  97.51 
 
 
763 aa  1375    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  89.52 
 
 
762 aa  1309    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  89.52 
 
 
762 aa  1309    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  89.52 
 
 
762 aa  1309    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  89.52 
 
 
762 aa  1309    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  56.36 
 
 
782 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  88.6 
 
 
762 aa  1301    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  94.5 
 
 
763 aa  1337    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
748 aa  1516    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  54.85 
 
 
782 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  89.65 
 
 
762 aa  1311    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
748 aa  1516    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  97.51 
 
 
763 aa  1375    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  38.93 
 
 
741 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  38 
 
 
741 aa  366  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  37.69 
 
 
689 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  37.98 
 
 
689 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  37.79 
 
 
643 aa  350  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  37.38 
 
 
646 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  36.95 
 
 
741 aa  336  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  36.54 
 
 
619 aa  326  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.49 
 
 
683 aa  324  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  36.79 
 
 
771 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.97 
 
 
683 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 
661 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  35.25 
 
 
616 aa  310  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  35.14 
 
 
780 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.37 
 
 
661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.05 
 
 
774 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.77 
 
 
756 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.77 
 
 
907 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  35.96 
 
 
572 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  35.58 
 
 
748 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  35.96 
 
 
838 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35.67 
 
 
668 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 
614 aa  300  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 
687 aa  300  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  33.84 
 
 
645 aa  300  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  35.58 
 
 
755 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 
841 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 
841 aa  297  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  36.12 
 
 
669 aa  297  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  35.06 
 
 
796 aa  297  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  33.14 
 
 
777 aa  296  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35 
 
 
788 aa  296  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  34.79 
 
 
680 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  33.04 
 
 
1003 aa  294  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  34.12 
 
 
775 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  34.12 
 
 
775 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
734 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
734 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.84 
 
 
668 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
734 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
734 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
734 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
731 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
734 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.58 
 
 
618 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  34.15 
 
 
757 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  32.4 
 
 
735 aa  291  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  34.6 
 
 
680 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
775 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 
734 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
694 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  34.44 
 
 
668 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 
731 aa  290  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  34.35 
 
 
734 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
775 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
775 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  32.24 
 
 
613 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35 
 
 
785 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
775 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
775 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 
841 aa  287  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  31.38 
 
 
748 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  34.08 
 
 
703 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 
702 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  32.7 
 
 
730 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.33 
 
 
729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  38.04 
 
 
767 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 
618 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.14 
 
 
729 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  33.97 
 
 
680 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  37.81 
 
 
767 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  34.89 
 
 
645 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 
763 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.31 
 
 
794 aa  280  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  33.4 
 
 
743 aa  280  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>