More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0531 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 1003 aa  2069    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  64.41 
 
 		 792 aa  972    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  34.07 
 
 		 741 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34.37 
 
 		 741 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.42 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.98 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 731 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  33.38 
 
 		 731 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  31.05 
 
 		 741 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  34.86 
 
 		 643 aa  365  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 		 734 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  35.16 
 
 		 646 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  35.19 
 
 		 757 aa  362  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 		 734 aa  360  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 774 aa  354  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.04 
 
 		 767 aa  344  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 748 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 788 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  35.89 
 
 		 767 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  32.69 
 
 		 778 aa  342  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.28 
 
 		 771 aa  341  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  30.33 
 
 		 792 aa  338  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  32.54 
 
 		 794 aa  338  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  32.17 
 
 		 730 aa  338  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 785 aa  336  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  29.45 
 
 		 907 aa  337  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  30.94 
 
 		 756 aa  337  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  31.74 
 
 		 777 aa  335  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.49 
 
 		 683 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  32.4 
 
 		 755 aa  333  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  32.64 
 
 		 796 aa  332  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 683 aa  332  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  31.44 
 
 		 794 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 		 572 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  32.12 
 
 		 780 aa  321  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  34.75 
 
 		 687 aa  318  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  33.28 
 
 		 901 aa  312  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  32.23 
 
 		 838 aa  311  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  32.47 
 
 		 975 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  32.23 
 
 		 841 aa  311  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  32.23 
 
 		 841 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  32.13 
 
 		 841 aa  310  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  32.47 
 
 		 886 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 		 762 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  32.36 
 
 		 748 aa  304  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  32.74 
 
 		 714 aa  303  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 661 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 661 aa  303  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  33.22 
 
 		 763 aa  302  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 661 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 661 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 661 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  32.54 
 
 		 763 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 661 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  32.54 
 
 		 763 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 661 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  32.86 
 
 		 669 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  32.54 
 
 		 763 aa  300  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  32.48 
 
 		 762 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 		 661 aa  295  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  32.75 
 
 		 748 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  32.75 
 
 		 748 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  32.75 
 
 		 748 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  32.75 
 
 		 748 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  32.18 
 
 		 613 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  31.81 
 
 		 783 aa  289  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  30.49 
 
 		 724 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 		 618 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  32.61 
 
 		 619 aa  288  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  30.16 
 
 		 782 aa  287  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  30.16 
 
 		 782 aa  287  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  29.35 
 
 		 712 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 775 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 775 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 775 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  30.34 
 
 		 730 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 769 aa  284  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 703 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  30.82 
 
 		 729 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  27.73 
 
 		 735 aa  281  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  31.79 
 
 		 1048 aa  282  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  30.99 
 
 		 729 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 741 aa  281  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 668 aa  280  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>