More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2959 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  60.37 
 
 
763 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  99.84 
 
 
782 aa  1295    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  60.06 
 
 
762 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  60.06 
 
 
762 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  60.53 
 
 
763 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  60.06 
 
 
762 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  99.69 
 
 
782 aa  1292    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  59.57 
 
 
762 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  60.53 
 
 
763 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  59.91 
 
 
762 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  60.06 
 
 
762 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  60.06 
 
 
762 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1311    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  60.06 
 
 
762 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  60.53 
 
 
763 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  59.91 
 
 
748 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  59.91 
 
 
748 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  59.91 
 
 
748 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  59.91 
 
 
748 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  38.05 
 
 
741 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  37.53 
 
 
741 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  31.4 
 
 
780 aa  273  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  36.34 
 
 
741 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  36.65 
 
 
643 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.91 
 
 
646 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  36.67 
 
 
689 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  37.4 
 
 
730 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  36.43 
 
 
689 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  37.01 
 
 
796 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  31.31 
 
 
794 aa  267  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  36.9 
 
 
729 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  36.9 
 
 
729 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  36.27 
 
 
775 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  36.27 
 
 
775 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 
619 aa  259  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  34.95 
 
 
743 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.8 
 
 
618 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  36.27 
 
 
775 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  36 
 
 
775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  36 
 
 
775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  36 
 
 
775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  35.79 
 
 
777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  36 
 
 
775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  31.39 
 
 
687 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  34.78 
 
 
714 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.88 
 
 
1981 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  31.55 
 
 
613 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  34.79 
 
 
774 aa  250  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
734 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
731 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
734 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
734 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
734 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
734 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  34.66 
 
 
1048 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  32.64 
 
 
683 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 
788 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 
724 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.1 
 
 
907 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  29.44 
 
 
741 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 
756 aa  248  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  31.75 
 
 
735 aa  247  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  34.47 
 
 
748 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
731 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  34.46 
 
 
734 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.26 
 
 
683 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  29.27 
 
 
741 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 
757 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 
872 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.58 
 
 
618 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 
858 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 
755 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 
896 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 
930 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  34.8 
 
 
778 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  34.29 
 
 
769 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.45 
 
 
709 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.47 
 
 
572 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  34.72 
 
 
1057 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 
734 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.63 
 
 
614 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  30.56 
 
 
748 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35.84 
 
 
668 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  33.91 
 
 
730 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  32.19 
 
 
645 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  34.8 
 
 
794 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.66 
 
 
668 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  34.38 
 
 
792 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  33.93 
 
 
734 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.81 
 
 
661 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  34.69 
 
 
661 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.55 
 
 
661 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  36.11 
 
 
680 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33 
 
 
703 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 
661 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 
661 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 
661 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 
661 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.29 
 
 
661 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35.7 
 
 
645 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>