42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2616 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  354  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  92.46 
 
 
199 aa  339  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3903  hypothetical protein  29.3 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3854  hypothetical protein  29.3 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  28.49 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4530  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.755873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3796  putative Bdr protein  24.73 
 
 
163 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3848  hypothetical protein  24.73 
 
 
163 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1710  hypothetical protein  26.89 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.150562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1691  hypothetical protein  26.89 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  20.73 
 
 
1153 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1215  hypothetical protein  21.51 
 
 
154 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  19.01 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  28.1 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  25.41 
 
 
708 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  26.81 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  24.86 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.23 
 
 
997 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4012  hypothetical protein  53.66 
 
 
45 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  22.36 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000234748  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  21.51 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  34.62 
 
 
113 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  21.95 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  24.64 
 
 
334 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.38 
 
 
448 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  23.03 
 
 
209 aa  44.7  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  28.46 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  24.84 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5612  hypothetical protein  41.43 
 
 
94 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  29.63 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1833  hypothetical protein  19.58 
 
 
421 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.678692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  24.39 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  22.58 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.62 
 
 
448 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1350  CopG domain protein DNA-binding domain protein  25.36 
 
 
332 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456617  normal  0.0319193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  21.58 
 
 
745 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.62 
 
 
448 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42675  predicted protein  29.75 
 
 
671 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  27.03 
 
 
809 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.9 
 
 
1186 aa  41.2  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  26 
 
 
1333 aa  41.2  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>