28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0549 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0549  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1557  hypothetical protein  38.82 
 
 
255 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  29.15 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  20.25 
 
 
1621 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  27.73 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  22.82 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  24.6 
 
 
1362 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2844  hypothetical protein  27.22 
 
 
164 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  33.04 
 
 
317 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  33.93 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  28.95 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  38.04 
 
 
368 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  38.04 
 
 
339 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  26.63 
 
 
694 aa  48.9  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 
1193 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0969  KID repeat-containing protein  26.37 
 
 
1702 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  20.11 
 
 
335 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  22 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2970  cell wall anchor domain-containing protein  30.5 
 
 
374 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  18.03 
 
 
257 aa  45.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  26.55 
 
 
2228 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  36.27 
 
 
294 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3242  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.87 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3266  cell wall anchor domain-containing protein  28.87 
 
 
372 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.821191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  26.67 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  26.67 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  24.04 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>