46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1496 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
985 aa  2029    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6303  hypothetical protein  40.7 
 
 
227 aa  151  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0395  hypothetical protein  33.61 
 
 
245 aa  134  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  unclonable  0.00000000458718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  33.33 
 
 
786 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4252  hypothetical protein  32.45 
 
 
251 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  31.2 
 
 
1209 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00975  hypothetical protein  28.94 
 
 
378 aa  80.9  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2554  hypothetical protein  32.28 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4744  hypothetical protein  30.82 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5211  hypothetical protein  30.82 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.398597  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5284  hypothetical protein  31.45 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246852  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3267  hypothetical protein  22.71 
 
 
383 aa  72  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2006  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  70.5  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2349  hypothetical protein  31.72 
 
 
235 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0146741  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  32.11 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
1991 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0398  hypothetical protein  23.67 
 
 
380 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4332  hypothetical protein  26.09 
 
 
233 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  26.16 
 
 
1049 aa  63.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0677  hypothetical protein  29.09 
 
 
249 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
415 aa  58.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31113  predicted protein  28.08 
 
 
1345 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  26.27 
 
 
3608 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1650  hypothetical protein  26.75 
 
 
248 aa  52.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.71 
 
 
1079 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2837  hypothetical protein  26.36 
 
 
405 aa  51.6  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2452  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
204 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633418  normal  0.137413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4404  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.96 
 
 
456 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.41 
 
 
1232 aa  50.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0073  ankyrin repeat-containing protein  30.84 
 
 
800 aa  49.3  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  26.49 
 
 
385 aa  48.5  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  19.64 
 
 
1177 aa  48.5  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.35 
 
 
1211 aa  48.1  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 
1189 aa  48.1  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 
1191 aa  47.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  26.26 
 
 
317 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  27.67 
 
 
958 aa  47.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  26.9 
 
 
243 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5046  hypothetical protein  25.93 
 
 
224 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1518  hypothetical protein  24.72 
 
 
496 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2690  peptidase  26.92 
 
 
607 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466836  normal  0.22304 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  25.97 
 
 
869 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 
1143 aa  45.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  24.78 
 
 
869 aa  44.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  24.78 
 
 
869 aa  44.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K30  hypothetical protein  33.62 
 
 
195 aa  44.7  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>