16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5284 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5284  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246852  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4744  hypothetical protein  91.25 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5211  hypothetical protein  91.25 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.398597  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2554  hypothetical protein  50.22 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0677  hypothetical protein  47.86 
 
 		 249 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1650  hypothetical protein  45.33 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2349  hypothetical protein  38.96 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4332  hypothetical protein  40.08 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  32.6 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1049 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2349  hypothetical protein  35.92 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5046  hypothetical protein  34.9 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6303  hypothetical protein  31.58 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  31.45 
 
 		 985 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0395  hypothetical protein  31.9 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  unclonable  0.00000000458718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4252  hypothetical protein  24.14 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>