15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2349 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  487  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4332  hypothetical protein  47.84 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1650  hypothetical protein  43.93 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2554  hypothetical protein  38.4 
 
 		 276 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0677  hypothetical protein  39.27 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5284  hypothetical protein  38.96 
 
 		 263 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246852  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4744  hypothetical protein  38.1 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5211  hypothetical protein  38.1 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.398597  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2349  hypothetical protein  36.65 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 415 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1049 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5046  hypothetical protein  35.29 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6303  hypothetical protein  34.19 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  31.72 
 
 		 985 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0395  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  unclonable  0.00000000458718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>