46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2452 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2452  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633418  normal  0.137413 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0815  hypothetical protein  49.06 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000735018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  37.5 
 
 		 985 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  36.62 
 
 		 786 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0297  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000113231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4351  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 133 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00465453  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1092 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0290  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3799  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  42.37 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0030  hypothetical protein  38.81 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  41.94 
 
 		 295 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3641  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  43.14 
 
 		 134 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0881  hypothetical protein  26.85 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3668  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000236869  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3707  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00576241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3538  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000633117  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3539  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3645  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3610  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  44.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  34.25 
 
 		 1232 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 581 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0469  protein of unknown function DUF1043  42 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1931  hypothetical protein  27.68 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0521  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  42.86 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000564363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0457  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  42.86 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000584634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1136  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  42.86 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00079606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3716  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000830331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03093  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00505365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0473  protein of unknown function DUF1043  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000169791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03044  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00266732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3422  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3543  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000300474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4550  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000433662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0473  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0195493  normal  0.11204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3529  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  47.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  39.34 
 
 		 1209 aa  44.7  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5342  response regulator receiver  44 
 
 		 910 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2666  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  35.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00191294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1480  hypothetical protein  37.74 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00879  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  26.09 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2752  hypothetical protein  33.85 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  44.23 
 
 		 557 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  26.83 
 
 		 478 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  29.91 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  33.33 
 
 		 405 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004513  hypothetical protein  25.93 
 
 		 147 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>