253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  47.18 
 
 
1177 aa  1008    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  37.71 
 
 
1110 aa  694    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  100 
 
 
1232 aa  2471    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
1132 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  29.79 
 
 
1132 aa  552  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  30.72 
 
 
1090 aa  535  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  31.12 
 
 
1211 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
1143 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  36.65 
 
 
947 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  32.45 
 
 
1016 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  34.91 
 
 
868 aa  370  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 
1068 aa  354  7e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  30.99 
 
 
859 aa  336  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  29.74 
 
 
876 aa  291  6e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 
917 aa  258  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
774 aa  244  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
792 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
792 aa  157  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  26.99 
 
 
787 aa  154  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.68 
 
 
791 aa  151  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
789 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
789 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  27.14 
 
 
793 aa  141  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
797 aa  137  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  25.97 
 
 
789 aa  136  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 
787 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
759 aa  131  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  26.38 
 
 
787 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  25.7 
 
 
788 aa  128  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  24.46 
 
 
788 aa  125  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  25.99 
 
 
787 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  25.36 
 
 
787 aa  124  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  25.32 
 
 
790 aa  121  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 
787 aa  118  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  24.59 
 
 
787 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  25.58 
 
 
787 aa  116  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 
792 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  25.74 
 
 
793 aa  115  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  23.95 
 
 
787 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 
788 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  24.07 
 
 
789 aa  112  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 
773 aa  112  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  22.94 
 
 
787 aa  112  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  24.06 
 
 
788 aa  109  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  26.05 
 
 
789 aa  108  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  25.18 
 
 
788 aa  107  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  25.04 
 
 
787 aa  107  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
790 aa  106  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
786 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  24.6 
 
 
800 aa  102  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.73 
 
 
782 aa  101  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 
787 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 
825 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  22.2 
 
 
1114 aa  100  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  23.32 
 
 
869 aa  100  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  23.32 
 
 
869 aa  100  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  23.32 
 
 
869 aa  100  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  31.18 
 
 
1092 aa  99  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.16 
 
 
869 aa  97.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 
787 aa  97.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  22.79 
 
 
787 aa  97.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  22.32 
 
 
791 aa  97.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 
749 aa  97.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  24.91 
 
 
787 aa  95.1  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
786 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 
786 aa  88.2  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  21.83 
 
 
793 aa  88.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 
737 aa  87  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  22.5 
 
 
923 aa  86.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  21.92 
 
 
924 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.71 
 
 
769 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  21.8 
 
 
911 aa  82  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  26.54 
 
 
786 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  22.66 
 
 
1111 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  26.96 
 
 
819 aa  77.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  26.09 
 
 
985 aa  76.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  21.94 
 
 
1038 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  21.45 
 
 
789 aa  74.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  22.14 
 
 
1038 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.45 
 
 
732 aa  73.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.06 
 
 
737 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  20.85 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.51 
 
 
683 aa  68.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  28 
 
 
362 aa  67.8  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  24.03 
 
 
666 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  23.28 
 
 
666 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  20.77 
 
 
1038 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  21.08 
 
 
1038 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  20.1 
 
 
772 aa  66.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  24.71 
 
 
1246 aa  66.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  21.03 
 
 
1041 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  22.38 
 
 
961 aa  65.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0383  hypothetical protein  30.7 
 
 
476 aa  65.1  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0266002  hitchhiker  0.0000000000664805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  28.97 
 
 
478 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  23.2 
 
 
666 aa  64.3  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  23.7 
 
 
666 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 
743 aa  63.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  20.26 
 
 
1038 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  23.54 
 
 
759 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  18.38 
 
 
915 aa  61.6  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>