126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2355 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
1016 aa  2048    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  33.21 
 
 
947 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 
1177 aa  548  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
1132 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.86 
 
 
1132 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  30.82 
 
 
1090 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 
1110 aa  435  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.82 
 
 
1211 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  34.38 
 
 
868 aa  361  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 
1143 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  32.15 
 
 
859 aa  340  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
1068 aa  328  5e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  33.19 
 
 
1232 aa  310  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  32.86 
 
 
876 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 
917 aa  284  7.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 
792 aa  224  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
774 aa  194  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.32 
 
 
791 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  24.69 
 
 
787 aa  138  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 
797 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 
792 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 
792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 
787 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 
759 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  23.7 
 
 
787 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  24.26 
 
 
787 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  21.94 
 
 
788 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
789 aa  118  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
789 aa  118  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 
787 aa  115  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 
786 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  22.43 
 
 
789 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  22.86 
 
 
787 aa  112  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  22.28 
 
 
793 aa  111  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  22.22 
 
 
787 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  22.97 
 
 
791 aa  111  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  23.71 
 
 
787 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  21.5 
 
 
788 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 
787 aa  108  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 
737 aa  107  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  23.84 
 
 
788 aa  107  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  24.2 
 
 
793 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  22.43 
 
 
800 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  21.07 
 
 
788 aa  106  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 
787 aa  104  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  22.8 
 
 
787 aa  103  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  25.21 
 
 
787 aa  102  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  23.66 
 
 
793 aa  101  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  22.89 
 
 
789 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  22.7 
 
 
789 aa  99.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 
773 aa  98.6  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  22.06 
 
 
787 aa  97.8  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 
786 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  21.96 
 
 
788 aa  95.9  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  20.63 
 
 
790 aa  94.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  21.58 
 
 
789 aa  94.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  22.09 
 
 
787 aa  93.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 
790 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  20.24 
 
 
961 aa  93.2  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  21.31 
 
 
786 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  20.85 
 
 
787 aa  87.4  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  20.68 
 
 
786 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
749 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  22.29 
 
 
786 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  20.6 
 
 
1092 aa  64.3  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.92 
 
 
835 aa  62.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  26.58 
 
 
829 aa  62.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 
743 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.24 
 
 
387 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.8 
 
 
811 aa  57.4  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  25.63 
 
 
958 aa  57  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  28.99 
 
 
896 aa  56.2  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 
839 aa  55.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
452 aa  55.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  23.43 
 
 
852 aa  53.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  23.43 
 
 
852 aa  53.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.45 
 
 
759 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 
791 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  20.19 
 
 
385 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  21.33 
 
 
828 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
383 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
833 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 
930 aa  52  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30 
 
 
427 aa  52  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.29 
 
 
836 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
855 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  31.71 
 
 
645 aa  49.3  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  21.9 
 
 
386 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  25.15 
 
 
825 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
855 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  25.87 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  25.87 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.87 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.32 
 
 
841 aa  48.9  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  25.87 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
859 aa  48.9  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 
384 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  25.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 
383 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>