More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1152 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 833 aa  1674    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  27.16 
 
 		 868 aa  237  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  26.57 
 
 		 829 aa  205  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  30.1 
 
 		 896 aa  183  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 		 967 aa  124  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  22.95 
 
 		 831 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  21.36 
 
 		 831 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1244  hypothetical protein  23.77 
 
 		 772 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  19.35 
 
 		 871 aa  95.9  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 855 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.09 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  20.5 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 852 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.64 
 
 		 825 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.02 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 856 aa  77.8  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 834 aa  77.8  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.57 
 
 		 835 aa  76.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0744  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 		 811 aa  76.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.37 
 
 		 836 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  21.75 
 
 		 850 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 838 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 413 aa  73.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  19.68 
 
 		 806 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.39 
 
 		 841 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 		 861 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  31.46 
 
 		 880 aa  68.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  24.88 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  32.56 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  21.16 
 
 		 855 aa  67.8  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 		 386 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  32.31 
 
 		 396 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  31.25 
 
 		 926 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  36.51 
 
 		 390 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1090 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 		 930 aa  65.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.23 
 
 		 842 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  31.11 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  21.94 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 857 aa  64.7  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  29.92 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  29.41 
 
 		 854 aa  64.7  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 		 897 aa  64.3  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.92 
 
 		 387 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 409 aa  63.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.86 
 
 		 386 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  23.37 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 822 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  32.18 
 
 		 648 aa  63.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  25.43 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  31.72 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  20.25 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  30.34 
 
 		 847 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  22.77 
 
 		 845 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 866 aa  62.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 383 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.66 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 849 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.33 
 
 		 851 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  33.33 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.61 
 
 		 858 aa  61.6  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.82 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 		 878 aa  61.6  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  19.2 
 
 		 861 aa  61.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.41 
 
 		 859 aa  61.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  31.25 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.37 
 
 		 642 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.11 
 
 		 389 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  36.22 
 
 		 410 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  23.79 
 
 		 408 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  30.23 
 
 		 393 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 443 aa  60.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  31.01 
 
 		 903 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  25.11 
 
 		 391 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.44 
 
 		 857 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  34.51 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.79 
 
 		 854 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.35 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  30.3 
 
 		 1090 aa  60.1  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.37 
 
 		 821 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.11 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.61 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.28 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  23.51 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  28.23 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  28.28 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>