More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2300 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
834 aa  1625    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  47.23 
 
 
843 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  47.8 
 
 
848 aa  653    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  45.28 
 
 
842 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  42.26 
 
 
847 aa  559  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  43.22 
 
 
845 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  42.31 
 
 
849 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  41.19 
 
 
849 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  39.11 
 
 
853 aa  459  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  39.42 
 
 
856 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  37.62 
 
 
852 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  38.34 
 
 
859 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  35.91 
 
 
855 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  38.89 
 
 
857 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36.59 
 
 
861 aa  399  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  35.15 
 
 
873 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  35.14 
 
 
854 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  37.01 
 
 
853 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  37.18 
 
 
806 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  37.69 
 
 
853 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  34.92 
 
 
836 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 
838 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  35.35 
 
 
873 aa  320  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 
861 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  32.4 
 
 
825 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  35.97 
 
 
866 aa  306  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 
821 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.52 
 
 
841 aa  289  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  34.4 
 
 
839 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.42 
 
 
828 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.79 
 
 
855 aa  240  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 
846 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 
801 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  33.63 
 
 
930 aa  209  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.19 
 
 
863 aa  197  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
878 aa  191  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.23 
 
 
880 aa  190  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 
871 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.37 
 
 
859 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 
897 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.35 
 
 
835 aa  170  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.93 
 
 
855 aa  158  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.17 
 
 
852 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.91 
 
 
858 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.26 
 
 
854 aa  145  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.44 
 
 
849 aa  145  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
857 aa  144  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 
828 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.07 
 
 
857 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 
855 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.38 
 
 
851 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.88 
 
 
850 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 
822 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 
838 aa  135  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
849 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.12 
 
 
841 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.93 
 
 
850 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.5 
 
 
870 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.59 
 
 
866 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.14 
 
 
807 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
849 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 
822 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.62 
 
 
856 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 
846 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
847 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  26.77 
 
 
843 aa  110  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.18 
 
 
858 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
852 aa  102  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
847 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.28 
 
 
850 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.77 
 
 
387 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
874 aa  98.6  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 
386 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.2 
 
 
858 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.32 
 
 
413 aa  94.4  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  23.89 
 
 
838 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 
386 aa  94  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 
386 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.08 
 
 
794 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.48 
 
 
855 aa  92.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.55 
 
 
393 aa  92  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  20.2 
 
 
835 aa  89.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.3 
 
 
386 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.69 
 
 
386 aa  89  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.19 
 
 
839 aa  88.6  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  30.18 
 
 
408 aa  88.6  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.89 
 
 
419 aa  87.8  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  24.1 
 
 
390 aa  87.4  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  30.36 
 
 
393 aa  86.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.56 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  22.96 
 
 
396 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.83 
 
 
829 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.88 
 
 
829 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  23.11 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.19 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>