195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0680 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
809 aa  1580    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  68.34 
 
 
805 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  41.94 
 
 
780 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  41.56 
 
 
809 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 
775 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 
779 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.33 
 
 
759 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.52 
 
 
849 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  24.22 
 
 
821 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  24.88 
 
 
866 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 
833 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  22.45 
 
 
802 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.85 
 
 
847 aa  62  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.41 
 
 
863 aa  62  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.17 
 
 
851 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.64 
 
 
416 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.02 
 
 
870 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
830 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 
413 aa  58.9  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  28.87 
 
 
453 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.97 
 
 
855 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
856 aa  56.6  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.9 
 
 
857 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.45 
 
 
850 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 
848 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
462 aa  54.7  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 
849 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 
443 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  24.44 
 
 
451 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
935 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 
855 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.08 
 
 
836 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  28.37 
 
 
756 aa  52.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 
834 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
845 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  29.44 
 
 
828 aa  52  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.56 
 
 
391 aa  52  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 
404 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 
873 aa  51.6  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 
852 aa  51.2  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.24 
 
 
821 aa  50.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  28.57 
 
 
416 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  28.06 
 
 
389 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.35 
 
 
843 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.26 
 
 
825 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 
930 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.03 
 
 
854 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.83 
 
 
397 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 
401 aa  50.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.05 
 
 
842 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  26.15 
 
 
406 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.44 
 
 
858 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  28.3 
 
 
416 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.91 
 
 
415 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  25.57 
 
 
843 aa  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 
849 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  33.08 
 
 
387 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  21.09 
 
 
805 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.46 
 
 
419 aa  49.3  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.59 
 
 
414 aa  49.3  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
402 aa  49.3  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  35.37 
 
 
855 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 
398 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
855 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  29.1 
 
 
407 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 
837 aa  48.9  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  24.91 
 
 
422 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  27.21 
 
 
393 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  28.76 
 
 
401 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.23 
 
 
397 aa  48.9  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 
853 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 
419 aa  48.9  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0381  hypothetical protein  21.08 
 
 
1481 aa  48.5  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.577318  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
878 aa  48.5  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 
407 aa  48.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
857 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 
853 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
400 aa  48.1  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
416 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  24.63 
 
 
878 aa  48.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.97 
 
 
394 aa  48.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.01 
 
 
737 aa  48.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 
467 aa  47.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.84 
 
 
415 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.62 
 
 
409 aa  47.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
386 aa  47.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.22 
 
 
416 aa  47.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  47.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 
649 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  30.49 
 
 
649 aa  47.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  23.77 
 
 
772 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.88 
 
 
414 aa  47.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  22.03 
 
 
872 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.62 
 
 
414 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  31.15 
 
 
425 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
395 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.81 
 
 
414 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.01 
 
 
885 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.81 
 
 
414 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.79 
 
 
420 aa  47  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>