268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1613 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 779 aa  1531    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  40.54 
 
 		 775 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  35.07 
 
 		 809 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  35.46 
 
 		 780 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  36.19 
 
 		 805 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  36.41 
 
 		 809 aa  328  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  25.38 
 
 		 821 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.76 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.41 
 
 		 408 aa  70.5  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.47 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 848 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  31.78 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.34 
 
 		 852 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 830 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.33 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.07 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.65 
 
 		 418 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.3 
 
 		 843 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.72 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  21.44 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  30.52 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 413 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  30.72 
 
 		 416 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.39 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.29 
 
 		 424 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  30.72 
 
 		 416 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.07 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.62 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.07 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.85 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.98 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.39 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.1 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.41 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  29.22 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.76 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.48 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  29.41 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.2 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.92 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  28.1 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.28 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.38 
 
 		 849 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.15 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.03 
 
 		 387 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.45 
 
 		 416 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.23 
 
 		 418 aa  57  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  22.14 
 
 		 405 aa  57.4  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 457 aa  56.6  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 423 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 861 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.85 
 
 		 422 aa  56.6  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  29.22 
 
 		 414 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 		 833 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.63 
 
 		 414 aa  56.6  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.41 
 
 		 415 aa  56.6  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 		 847 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.49 
 
 		 416 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 466 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.49 
 
 		 416 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.76 
 
 		 415 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  28.57 
 
 		 427 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  29.41 
 
 		 416 aa  55.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  29.22 
 
 		 414 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.81 
 
 		 415 aa  55.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.89 
 
 		 423 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  29.57 
 
 		 849 aa  55.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  20.07 
 
 		 397 aa  55.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 386 aa  54.7  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.93 
 
 		 397 aa  54.7  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.28 
 
 		 419 aa  54.3  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.29 
 
 		 415 aa  54.3  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 859 aa  54.3  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.8 
 
 		 416 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  27.92 
 
 		 433 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.72 
 
 		 397 aa  53.5  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.93 
 
 		 854 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.37 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.76 
 
 		 416 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.11 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.97 
 
 		 414 aa  53.5  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  28.26 
 
 		 404 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.77 
 
 		 855 aa  53.5  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  26.73 
 
 		 819 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.11 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.23 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.03 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  28.7 
 
 		 849 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 838 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 443 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 845 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  28.87 
 
 		 393 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1014  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.21 
 
 		 418 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  24.01 
 
 		 828 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.58 
 
 		 414 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 452 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.49 
 
 		 416 aa  51.6  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.49 
 
 		 439 aa  51.6  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  25.66 
 
 		 418 aa  50.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>