More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0289 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
457 aa  909    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  32.64 
 
 
452 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3702  hypothetical protein  31.69 
 
 
449 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.962253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3172  hypothetical protein  32.41 
 
 
471 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.534068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  43.68 
 
 
467 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  44.02 
 
 
443 aa  156  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  27.41 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.16 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  35.64 
 
 
453 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  38.16 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  39.78 
 
 
397 aa  112  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.9 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  37.3 
 
 
419 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  37.43 
 
 
420 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
405 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  23.82 
 
 
393 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.8 
 
 
397 aa  103  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  27.27 
 
 
397 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
414 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  33.85 
 
 
650 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.84 
 
 
391 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  30.74 
 
 
394 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.67 
 
 
401 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  36.55 
 
 
647 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  36.41 
 
 
395 aa  98.2  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.23 
 
 
391 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.25 
 
 
644 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.88 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.54 
 
 
642 aa  97.1  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  39.66 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.22 
 
 
400 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  38.59 
 
 
397 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  33.55 
 
 
696 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  38.1 
 
 
403 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  33.97 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  36.48 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  39.44 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.44 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  38.34 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.23 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.23 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.84 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.16 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.23 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  38.1 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  39.01 
 
 
397 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  38.59 
 
 
397 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 
405 aa  94  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  35.77 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.68 
 
 
383 aa  94  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.42 
 
 
640 aa  93.6  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  32.79 
 
 
400 aa  93.2  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  34.81 
 
 
641 aa  92.8  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  35.86 
 
 
404 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.17 
 
 
656 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  37.5 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 
408 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.77 
 
 
653 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
383 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  25.82 
 
 
409 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  40 
 
 
387 aa  91.3  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  35.17 
 
 
682 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  35.17 
 
 
682 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.19 
 
 
647 aa  90.5  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 
383 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  35.17 
 
 
667 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  35.17 
 
 
667 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  34.48 
 
 
656 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
410 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  33.33 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.62 
 
 
394 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
649 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.91 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.26 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.81 
 
 
642 aa  88.2  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.09 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  25.5 
 
 
651 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.62 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  33.16 
 
 
396 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  29.02 
 
 
653 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.09 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  31.75 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  34.84 
 
 
652 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  31.08 
 
 
646 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.91 
 
 
648 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  32.91 
 
 
648 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
648 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  33.81 
 
 
397 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  32.91 
 
 
648 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.91 
 
 
648 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  40.34 
 
 
397 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.91 
 
 
648 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  34.87 
 
 
401 aa  87.4  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.36 
 
 
398 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  32.69 
 
 
408 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>