More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3172 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  949    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.534068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  44.63 
 
 		 452 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  36.16 
 
 		 467 aa  282  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  34.27 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3702  hypothetical protein  34.62 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.962253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.49 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.89 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  27.29 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.2 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.04 
 
 		 397 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  36.22 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  26.82 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.75 
 
 		 397 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  26.15 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  26.09 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.05 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.48 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.58 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.71 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 		 414 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.66 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  23.06 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  27.41 
 
 		 666 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.53 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  25.1 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  26.67 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.05 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  25.1 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  24.44 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 405 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  25.11 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  26.1 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.71 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.26 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.45 
 
 		 404 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  34.95 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  27.12 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  25.59 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  23.89 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.15 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.21 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.64 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.74 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.23 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.43 
 
 		 405 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  103  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.84 
 
 		 391 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  24.05 
 
 		 643 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.44 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.68 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  24.63 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  25.66 
 
 		 656 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.9 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  24.63 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  24.63 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25.05 
 
 		 657 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  24.63 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.49 
 
 		 664 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  24.63 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  34.5 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  23.86 
 
 		 402 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.05 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.05 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  26.23 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.89 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.48 
 
 		 400 aa  97.8  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  23.86 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  24.95 
 
 		 657 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  23.63 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 466 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.27 
 
 		 642 aa  96.7  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  23.17 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  25.78 
 
 		 715 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  31.38 
 
 		 394 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  34.87 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  23.72 
 
 		 653 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 403 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.91 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 397 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  35.62 
 
 		 647 aa  93.6  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  36.99 
 
 		 648 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  36.99 
 
 		 648 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.85 
 
 		 648 aa  93.2  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>